طراحی بیوانفورماتیکی و آنالیز ایمونوژن کایمر علیه اتصال و سمیت باکتری ویبریوکلرا

نویسندگان

  • آقایی, مجتبی کارشناس‌ارشد سلولی و مولکولی مرکز تحقیقات زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه جامع امام حسین (ع)، تهران، ایران
  • بهروزی, محمد دانشجوی کارشناس‌ارشد زیست‌شناسی گرایش سلولی و مولکولی، دانشگاه جامع امام حسین (ع)، تهران، ایران
  • نظریان, شهرام استادیار مرکز تحقیقات زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه جامع امام حسین (ع)، تهران، ایران
چکیده مقاله:

زمینه و هدف: بیماری‌های اسهالی ناشی از باکتری‌های روده‌ای عامل مهم مرگ‌ومیر در کشورهای در حال توسعه به‌ویژه در کودکان زیر پنج سال است. واکسن‌ها می‌توانند راه‌حل مهمی برای پیشگیری از این بیماری‌ باشند. فاکتور کلونیزاسیون پیلی (TcpA)، پروتئین غشای خارجی W و توکسین‌کلرا مهم‌ترین عوامل بیماری‌زایی ویبریوکلرا هستند و ویژگی‌های ایمونوژنیک دارند. در این مطالعه، ایمونوژنی نوترکیب سه‌گانه متشکل از TcpA, CTXB OMPW, طراحی شد. پروتئین کایمر که دربردارنده اپی‌توپ‌های B-cell و توالی با خاصیت ادجوانتی است، می‌تواند به‌طور بالقوه احتمال بروز پاسخ‌های ایمنی مؤثر را افزایش دهد. مواد و روش‌ کار: برای افزایش احتمال بیان پروتئین OTC، کدون‌های ژنی و انواع پارامترهای مؤثر در بیان بهینه شد و تجزیه‌وتحلیل ترمودینامیکی ساختار mRNA با هدف بررسی پایداری انجام گرفت. همچنین ساختار سوم پروتئین پیش‌بینی شد، کیفیت ساختارها ارزیابی، و اپی‌توپ‌های خطی و فضایی نیز تعیین شد. یافته‌ها: پروتئین با ترتیب توالی OTC بیشترین شاخص آنتی‌ژنی را نشان داد. شاخص سازگاری کدون سازه کایمری به ۰/۸۹ افزایش یافت. ساختار سوم پیش‌بینی‌شده براساس سرور RaptorX کیفیت مناسبی را نشان داد. آنالیز ترمودینامیکی ساختار mRNA نشان داد ساختار پیش‌بینی‌شده پایدار است. اپی‌توپ‌های فضایی و خطی در هر سه دومین پروتئین کایمر دیده شد. نتیجه‌گیری: نتایج نشان داد پروتئین حاصل از این ساختار طراحی‌شده می‌تواند در برابر عملکرد اتصال و توکسین باکتری ویبریوکلرا مانند یک ایمونوژن عمل کند.  

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

طراحی بیوانفورماتیکی و ساخت ژن کایمر دربردارنده زیر واحد B کلراتوکسین و زیر واحد A پیلی ویبریو کلرا

زمینه و اهداف: وبا بیماری خطرناکی است که توسط ویبریو کلرا ایجاد می‌شود. فاکتور کلونیزاسیون پیلی Toxin-coregulated pili A (tcpA) و توکسین کلرا مهم‌ترین عوامل بیماری‌زایی ویبریوکلرا می‌باشند. زیر واحد B انتروتوکسین  Cholera toxin subunit B (ctxB)مسئول اتصال سم به سلول یوکاریوتی است و tcpA که برای کلونیزاسیون باکتری ضروری است، ویژگی‌های ایمونوژنیک دارند. پروتئین‌های کایمر دربردارنده اپی توپ و ادجو...

متن کامل

طراحی سازه ژنی نوترکیب بیان کننده پروتئین کایمر ctb-pad۴ و بررسی ویژگی های بیوانفورماتیکی آن

شیوع سیاه زخم طبیعی در انسان نادر است اما از آنجایی که این باکتری پتانسیل بالایی جهت استفاده به عنوان سلاح بیولوژیکی دارد تلاش ها برای تولید واکسن علیه این باکتری رو به افزایش است. ترکیب آنتی ژن ها با زیرواحد b کلرا توکسین ctb می تواند پاسخ آنتی بادی موکوزی قوی ایجاد نماید و به عنوان واکسن معرفی شود. در این مطالعه، ابتدا توالی های مربوطه از پایگاه داده ncbi اخذ و پس از بهینه سازی، از لینکری منا...

متن کامل

ارزیابی ایمنی زائی پروتئین کایمر نوترکیب در بردارنده Intimin - EspA -Stx2b علیه باکتری E.coli O157 H7

زمینه و هدف: انتروهموراژیک اشرشیا کلی (EHEC)  باعث طیف گسترده ای از عفونت ها مانند اسهال، کولیت هموراژی و سندرم همولیتیک اورمیک می شود. با توجه به خطرات ناشی از درمان آنتی بیوتیکی در عفونت E.coli O157: H7، واکسن ها روشی امید بخش برای پیشگیری از عفونت را ارائه می کنند.  پروتئین های کایمر نوترکیب دربردارنده چندین ایمونوژن  می توانند ایجاد ایمنی علیه عفونت های باکتریایی را القاء کنند. هدف از این م...

متن کامل

مطالعه فیلوژنتیکی باکتری سودوموناس پوتیدا تولید کننده پرولین دهیدروژناز و آنالیز بیوانفورماتیکی آنزیم جداسازی شده

فلاو آنزیم پرولین دهیدروژناز (EC 1.5.99.8) نقش مهمی را در زیست حسگرها و کیتهای غربالگری به منظور تشخیص بیماریهای متابولیک مرتبط با نقص پرولین ایفاء می نماید. هدف از این تحقیق، جداسازی و تعیین مشخصات میکروارگانیسم های تولید کننده آنزیمهای دخیل در متابولیسم پرولین از نمونه های خاک ایران بود. غربالگری آنزیم های تخریب کننده L-پرولین از نمونه های خاک در سه مرحله شامل تکنیک کشت غنی، کروماتوگرافی لایه...

متن کامل

The Effects of 8 Weeks of Vitamin C Intake and Regular Aerobic Exercise on Serum Brain-Derived Neurotrophic Factor and Insulin-like Growth Factor-1 Levels in Obese Girls

شور و داوم اه : ،یبرجت همین قیقحت نیا رد 28 نیماتیو ،نیرمت ،لرتنک هورگ راهچ هب یفداصت روط هب و باختنا قاچ رتخد C یبیکرت و دندش میسقت . نیرمت تدش اب يزاوه 50 ات 70 ،رثکادح بلق نابرض دصرد 3 تدم هب و هتفه رد هسلج 8 هتفه دش ماجنا . هورگ ياه نیماتیو C و صرق یبیکرت 500 یلیم نیماتیو یمرگ C ار 3 فرصم هتفه رد راب دندومن . هنومن و لبق اتشان ینوخ ياه 48 هلخادم نیرخآ زا سپ تعاس اه عم...

متن کامل

Immune and non-immune assays

تاسياقلما فلتخم ىلع ءوضلا ضعب ءاقلإ تم ةعجارلما هذه يف دضتسلماب دضلا تلاعافت ىلع دمتعت يتلا ةموسولما ةيعانلما ةيعانلما و ،ةيقلأتلا ةيعانلما تاسايقلما لمشت يتلاو Ag-Ab هذه فيرعت تم .)EIA, ELISA( ةييمزنلإا ةيعانلما و ،ةيعاعشلا و تلاعافتلا أدبلم رصتخم فصو عم لًاوأ ةثلاثلا تاسياقلما اهروطت حيضوتل يخيراتلا جردتلا بسح تشقون مث ،تاقيبطتلا امك .لماك لكشب ةيلآ ةينقت ىلإ ةياهنلا يف داق يذلا يجيردتلا ةخطلل...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


عنوان ژورنال

دوره 12  شماره 4

صفحات  269- 279

تاریخ انتشار 2018-10

با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.

کلمات کلیدی

کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023